MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL840

Total Repeats: 1862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011311	GAA	2	6	67500	67505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778408
1502	NC_011311	ATA	2	6	67509	67514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1503	NC_011311	CTT	2	6	67552	67557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778408
1504	NC_011311	T	6	6	67556	67561	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1505	NC_011311	T	6	6	67569	67574	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1506	NC_011311	T	6	6	67577	67582	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1507	NC_011311	AAT	2	6	67591	67596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1508	NC_011311	ATA	2	6	67612	67617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1509	NC_011311	ATC	2	6	67628	67633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778408
1510	NC_011311	TAA	2	6	67646	67651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1511	NC_011311	AT	3	6	67658	67663	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1512	NC_011311	TA	4	8	67699	67706	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1513	NC_011311	TTG	2	6	67720	67725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778408
1514	NC_011311	ATA	2	6	67746	67751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1515	NC_011311	T	6	6	67764	67769	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1516	NC_011311	ATA	2	6	67770	67775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1517	NC_011311	TAAAT	2	10	67778	67787	60 %	40 %	0 %	0 %	215778408
1518	NC_011311	T	7	7	67818	67824	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1519	NC_011311	TAA	2	6	67835	67840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1520	NC_011311	AT	3	6	67942	67947	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1521	NC_011311	TAA	2	6	68017	68022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1522	NC_011311	TTA	2	6	68037	68042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778408
1523	NC_011311	TA	3	6	68119	68124	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1524	NC_011311	TTAC	2	8	68127	68134	25 %	50 %	0 %	25 %	215778408
1525	NC_011311	TTA	2	6	68160	68165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778408
1526	NC_011311	AT	3	6	68170	68175	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1527	NC_011311	TAT	2	6	68201	68206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778408
1528	NC_011311	ATA	2	6	68236	68241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1529	NC_011311	AACC	2	8	68245	68252	50 %	0 %	0 %	50 %	215778408
1530	NC_011311	AT	3	6	68272	68277	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1531	NC_011311	TAT	2	6	68288	68293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778408
1532	NC_011311	AAATA	2	10	68308	68317	80 %	20 %	0 %	0 %	215778408
1533	NC_011311	TC	3	6	68337	68342	0 %	50 %	0 %	50 %	215778408
1534	NC_011311	TTA	2	6	68368	68373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778408
1535	NC_011311	T	6	6	68387	68392	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1536	NC_011311	TCA	2	6	68418	68423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778408
1537	NC_011311	TTCTT	2	10	68426	68435	0 %	80 %	0 %	20 %	215778408
1538	NC_011311	TAA	2	6	68456	68461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1539	NC_011311	ATA	2	6	68462	68467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1540	NC_011311	CAT	3	9	68584	68592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778408
1541	NC_011311	ATA	2	6	68615	68620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1542	NC_011311	T	6	6	68637	68642	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1543	NC_011311	TAT	2	6	68728	68733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778408
1544	NC_011311	A	6	6	68761	68766	100 %	0 %	0 %	0 %	215778408
1545	NC_011311	TAA	2	6	68909	68914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1546	NC_011311	ATA	2	6	69014	69019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778408
1547	NC_011311	CTA	2	6	69028	69033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778408
1548	NC_011311	AT	3	6	69052	69057	50 %	50 %	0 %	0 %	215778408
1549	NC_011311	GAA	2	6	69103	69108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778408
1550	NC_011311	T	6	6	69111	69116	0 %	100 %	0 %	0 %	215778408
1551	NC_011311	ATA	2	6	69404	69409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778409
1552	NC_011311	T	6	6	69420	69425	0 %	100 %	0 %	0 %	215778409
1553	NC_011311	AGAA	2	8	69471	69478	75 %	0 %	25 %	0 %	215778409
1554	NC_011311	GT	3	6	69559	69564	0 %	50 %	50 %	0 %	215778409
1555	NC_011311	CAG	2	6	69602	69607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778409
1556	NC_011311	GAAAT	2	10	69704	69713	60 %	20 %	20 %	0 %	215778409
1557	NC_011311	AGAT	2	8	69765	69772	50 %	25 %	25 %	0 %	215778409
1558	NC_011311	T	8	8	69803	69810	0 %	100 %	0 %	0 %	215778409
1559	NC_011311	A	8	8	69894	69901	100 %	0 %	0 %	0 %	215778409
1560	NC_011311	TCTT	2	8	69903	69910	0 %	75 %	0 %	25 %	215778409
1561	NC_011311	A	6	6	69979	69984	100 %	0 %	0 %	0 %	215778409
1562	NC_011311	A	6	6	70013	70018	100 %	0 %	0 %	0 %	215778409
1563	NC_011311	TATT	2	8	70088	70095	25 %	75 %	0 %	0 %	215778410
1564	NC_011311	T	8	8	70105	70112	0 %	100 %	0 %	0 %	215778410
1565	NC_011311	TGA	2	6	70123	70128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778410
1566	NC_011311	GAA	2	6	70153	70158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215778410
1567	NC_011311	CAA	2	6	70245	70250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778410
1568	NC_011311	TCT	2	6	70289	70294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778410
1569	NC_011311	T	6	6	70337	70342	0 %	100 %	0 %	0 %	215778410
1570	NC_011311	TTG	2	6	70383	70388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778410
1571	NC_011311	TCG	2	6	70390	70395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778410
1572	NC_011311	TAT	2	6	70413	70418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778410
1573	NC_011311	ATAA	2	8	70442	70449	75 %	25 %	0 %	0 %	215778410
1574	NC_011311	TAA	3	9	70447	70455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778410
1575	NC_011311	CTT	2	6	70460	70465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778410
1576	NC_011311	TTC	2	6	70471	70476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778410
1577	NC_011311	A	6	6	70543	70548	100 %	0 %	0 %	0 %	215778410
1578	NC_011311	GGT	2	6	70584	70589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215778410
1579	NC_011311	ATG	2	6	70660	70665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778410
1580	NC_011311	ACC	2	6	70699	70704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	215778410
1581	NC_011311	ATA	2	6	70707	70712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215778410
1582	NC_011311	CAT	2	6	70740	70745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778410
1583	NC_011311	GTT	2	6	70763	70768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778410
1584	NC_011311	T	6	6	70875	70880	0 %	100 %	0 %	0 %	215778410
1585	NC_011311	TTG	2	6	70894	70899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778410
1586	NC_011311	AC	3	6	70920	70925	50 %	0 %	0 %	50 %	215778410
1587	NC_011311	ATC	2	6	70930	70935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778410
1588	NC_011311	TAAC	2	8	70959	70966	50 %	25 %	0 %	25 %	215778410
1589	NC_011311	GA	3	6	70974	70979	50 %	0 %	50 %	0 %	215778410
1590	NC_011311	CTA	2	6	70983	70988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215778410
1591	NC_011311	TAGT	2	8	71007	71014	25 %	50 %	25 %	0 %	215778410
1592	NC_011311	ATT	2	6	71056	71061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778410
1593	NC_011311	CATTT	2	10	71063	71072	20 %	60 %	0 %	20 %	215778410
1594	NC_011311	CT	3	6	71098	71103	0 %	50 %	0 %	50 %	215778411
1595	NC_011311	TTG	2	6	71110	71115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215778411
1596	NC_011311	AATT	2	8	71130	71137	50 %	50 %	0 %	0 %	215778411
1597	NC_011311	TAT	2	6	71145	71150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215778411
1598	NC_011311	TTCCA	2	10	71163	71172	20 %	40 %	0 %	40 %	215778411
1599	NC_011311	TTC	2	6	71452	71457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778411
1600	NC_011311	TTTTCA	2	12	71507	71518	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	215778411
1601	NC_011311	TAG	2	6	71610	71615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778411
1602	NC_011311	CT	3	6	71624	71629	0 %	50 %	0 %	50 %	215778411
1603	NC_011311	AC	3	6	71641	71646	50 %	0 %	0 %	50 %	215778411
1604	NC_011311	TGC	2	6	71706	71711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778412
1605	NC_011311	AT	3	6	71729	71734	50 %	50 %	0 %	0 %	215778412
1606	NC_011311	TTC	2	6	71802	71807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778412
1607	NC_011311	TAGA	2	8	72005	72012	50 %	25 %	25 %	0 %	215778412
1608	NC_011311	CTG	2	6	72044	72049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215778412
1609	NC_011311	TCT	2	6	72063	72068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778412
1610	NC_011311	TGCT	2	8	72083	72090	0 %	50 %	25 %	25 %	215778412
1611	NC_011311	CAA	2	6	72095	72100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215778412
1612	NC_011311	GTAA	2	8	72103	72110	50 %	25 %	25 %	0 %	215778412
1613	NC_011311	T	6	6	72123	72128	0 %	100 %	0 %	0 %	215778412
1614	NC_011311	TC	3	6	72189	72194	0 %	50 %	0 %	50 %	215778412
1615	NC_011311	AT	3	6	72310	72315	50 %	50 %	0 %	0 %	215778412
1616	NC_011311	CTT	2	6	72472	72477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215778412
1617	NC_011311	CAG	2	6	72494	72499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778412
1618	NC_011311	GAC	2	6	72562	72567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215778412
1619	NC_011311	TC	3	6	72673	72678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_011311	GAG	2	6	72709	72714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011311	GGA	2	6	72763	72768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	215778413
1622	NC_011311	TTCT	2	8	72807	72814	0 %	75 %	0 %	25 %	215778413
1623	NC_011311	T	6	6	72845	72850	0 %	100 %	0 %	0 %	215778413
1624	NC_011311	GCC	2	6	72871	72876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215778413
1625	NC_011311	T	6	6	72886	72891	0 %	100 %	0 %	0 %	215778413
1626	NC_011311	ATG	2	6	72900	72905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215778413
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.